Farmaceutische apparatuur is apparatuur dat wordt gebruikt voor het ontwikkelen van bijvoorbeeld medicijnen en vaccins. De invetseringen in dit soort apparatuur zijn vaak groot. Enkele voorbeelden van farmaceutische apparatuur zijn farmaceutische koelkasten, vriezers, wasdrogers, bioreactoren, meng-, oplsag-, proces- en transportvaten, skids, en fermentoren.